《大航海探险物语》的游戏中玩家可以通过转职选择各种职业和辅助职业，商店类型的职业有包括铁匠、商人、发明家还有经营者。这几个职业可以在船内开设商店，商人职业可以开设道具店，铁匠可以开始武器店，发明家则是开始防具店，经营者会开始饰品店。以上这四种职业玩家一定不要招募，因为任何职业都可以转职成为这四种职业之一，而且都可以开店。
商店的作用有三种，第一顶是可以赚到更多的钱。当玩家将船停在有建筑的岛屿上，建筑中的NPC就会来到船上进行购物，当你的商店里有商品的时候，可以获得的金币水量就会增加，而商品是通过解析物获得的。所以玩家可以看到，当角色在使用解析室的时候，会在左侧出现小的礼品盒，解析完之后这些礼品盒就会自动送到各个商店中去。
第二点就是可以快速的增加岛上的建筑物的经验值哦，每一个来船上购买物品的PNC，在购物结束之后就会在头上显示加了多少经验，这也表示他所在的建筑物增加了多少经验，这会比玩家去岛上讨饭的经验要更多。第三点就是岛上的居民购物之后的满意度，可以随机获得各种道具或者是装备。四种商店也分别对应着
不同的商店满意度，当满意度的进度条满了之后，就会获得物品。游戏中的满意度也可以在大地图上点击【岛屿】进行查看哦。
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